Service Omero

Open Microscopy Environment (OMERO) für Mikroskopie-Daten.

Mit dem Open Microscopy Environment webbasierten Software OMERO können Sie Bilder in einem sicheren zentralen Repository verwalten. Die Daten können von überall angezeigt, organisiert, analysiert und geteilt werden. Die Software eignet sich insbesondere für die Prozessierung und Verarbeitung von Mikroskopie-Daten in den Lebenswissenschaften. 

Die Kernfeatures im Überblick:

  • Nutzung der Web-Anwendung
  • Zugriff über Desktop-Anwendung (Windows, Max, Linux)
  • Verwendung einer API zur Anbindung individueller Clients
  • Unterstützung von über 150 Bilddateiformaten (darunter insb. die gängigsten Mikroskopformate)
  • Umsetzung auf leistungsstarker Infrastruktur mit skalierbaren Ressourcen
  • breitbandiger Zugriff auf die Forschungsdaten des Speicherdienstes SDS@hd

Der Dienst basiert auf der Open-Source-Software OMERO und wird am Universitätsrechenzentrum gehostet. Sämtliche Daten verbleiben auf universitären Servern. Der Dienst wird von der Research Data Unit betrieben und betreut, einer Gemeinschaftseinrichtung der Universitätsbibliothek und des Universitätsrechenzentrums, die zentrale Dienste zur Archivierung und Veröffentlichung von Forschungsdaten anbieten.

Zielgruppe

  • Forschende
  • Studierende
  • Beschäftigte

Nutzen

  • Anzeige, Verwaltung und Analyse/Prozessierung von Bilddaten, insbesondere von Mikroskopbilddaten aus den Lebenswissenschaften
  • Digitale Verwaltung von Bilddaten für Einzelanwender:innen und im Team
  • Unterstützung beim Labormanagement, z.B. durch Strukturierung der Bilddaten und Erfassung von standardisierten Metadaten
  • Vereinfachung von Teilen und Publizieren von Bilddaten

Zugang und Voraussetzungen

Der Service OMERO für die Universität Heidelberg befindet sich derzeit in der Closed Beta-Phase. Uni-ID-Inhaber:innen können einen Zugang für Ihre Arbeitsgruppe per E-Mail an den OMERO-Support beantragen.

Bitte beachten Sie: Der Service sollte in der Closed-Beta-Phase nur zu Testzwecken genutzt werden. Sämtliche Daten könnten unwiederbringlich gelöscht werden. Weitere Informationen zur stufenweisen Dienstöffnung finden Sie im verlinkten Informationstext.

Schulungen & Anleitungen

Research Data Unit (RDU)

Schulung, Beratung und Support zu OMERO bietet die Research Data Unit (RDU). Die RDU ist eine gemeinsame Serviceeinrichtung des URZ und der Universitätsbibliothek.

Alle Anleitungen